Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCAF4Q8WV16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DCAF4Q8WV16 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCAF4Q8WV16 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCAF4Q8WV16 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms