Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DDX54Q8TDD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
DDX54Q8TDD1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDX54Q8TDD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms