Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGARPQ8TDB4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MGARPQ8TDB4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms