Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR5

CIRBP-AS1, Putative uncharacterized protein CIRBP-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-AS1Q8TBR5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBP-AS1Q8TBR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CIRBP-AS1Q8TBR5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms