Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBA3Q8TBC4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBA3Q8TBC4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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