Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA3

PSMA8, Proteasome subunit alpha type-7-like, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA8Q8TAA3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA8Q8TAA3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA8Q8TAA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMA8Q8TAA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMA8Q8TAA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMA8Q8TAA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA8Q8TAA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMA8Q8TAA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms