Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID1BQ8NFD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID1BQ8NFD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ARID1BQ8NFD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID1BQ8NFD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms