Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC9Q8NEP7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KLHDC9Q8NEP7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHDC9Q8NEP7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHDC9Q8NEP7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms