Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
AGBL3Q8NEM8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AGBL3Q8NEM8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGBL3Q8NEM8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGBL3Q8NEM8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms