Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM2

SHCBP1, SHC SH2 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1Q8NEM2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHCBP1Q8NEM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SHCBP1Q8NEM2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SHCBP1Q8NEM2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms