Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM1BQ8NB78 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM1BQ8NB78 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM1BQ8NB78 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms