Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTLL6Q8N841 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTLL6Q8N841 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTLL6Q8N841 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTLL6Q8N841 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms