Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHCHD4Q8N4Q1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHCHD4Q8N4Q1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD4Q8N4Q1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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