Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4A0

GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT4Q8N4A0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALNT4Q8N4A0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT4Q8N4A0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT4Q8N4A0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms