Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CA13Q8N1Q1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CA13Q8N1Q1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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CA13Q8N1Q1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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CA13Q8N1Q1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CA13Q8N1Q1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
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