Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GPC2Q8N158 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPC2Q8N158 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPC2Q8N158 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms