Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIRREL3Q8IZU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIRREL3Q8IZU9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIRREL3Q8IZU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIRREL3Q8IZU9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIRREL3Q8IZU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms