Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP3Q8IZU3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCP3Q8IZU3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCP3Q8IZU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms