Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNA2D3Q8IZS8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA2D3Q8IZS8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D3Q8IZS8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms