Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DZIP3Q86Y13 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DZIP3Q86Y13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
DZIP3Q86Y13 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DZIP3Q86Y13 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DZIP3Q86Y13 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DZIP3Q86Y13 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DZIP3Q86Y13 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
DZIP3Q86Y13 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3273.3 ms