Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG3Q86VR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETREG3Q86VR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms