Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YTHDF3Q7Z739 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
YTHDF3Q7Z739 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms