Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP2Q7RTS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
OTOP2Q7RTS6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms