Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP1Q7RTM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP1Q7RTM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP1Q7RTM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms