Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
HECW1Q76N89 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
HECW1Q76N89 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
HECW1Q76N89 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
HECW1Q76N89 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms