Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPUQ71F23 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPUQ71F23 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPUQ71F23 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms