Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWK6

TMPRSS11F, Transmembrane protease serine 11F, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11FQ6ZWK6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMPRSS11FQ6ZWK6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPRSS11FQ6ZWK6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPRSS11FQ6ZWK6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms