Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC149Q6ZUS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC149Q6ZUS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms