Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY4Q6ZNE9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUFY4Q6ZNE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RUFY4Q6ZNE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms