Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF111Q6ZNA4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF111Q6ZNA4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF111Q6ZNA4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms