Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARA5Q6ZMJ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARA5Q6ZMJ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCARA5Q6ZMJ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCARA5Q6ZMJ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms