Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINGO4Q6UY18 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINGO4Q6UY18 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINGO4Q6UY18 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms