Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEACAM20Q6UY09 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CEACAM20Q6UY09 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEACAM20Q6UY09 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEACAM20Q6UY09 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms