Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM198BQ6UWH4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM198BQ6UWH4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM198BQ6UWH4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms