Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A10Q6U841 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SLC4A10Q6U841 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLC4A10Q6U841 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLC4A10Q6U841 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SLC4A10Q6U841 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SLC4A10Q6U841 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SLC4A10Q6U841 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms