Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC174Q6PII3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC174Q6PII3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC174Q6PII3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC174Q6PII3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms