Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C22orf39Q6P5X5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C22orf39Q6P5X5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C22orf39Q6P5X5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms