Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN12Q6JVE5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN12Q6JVE5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN12Q6JVE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN12Q6JVE5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN12Q6JVE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN12Q6JVE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN12Q6JVE5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LCN12Q6JVE5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LCN12Q6JVE5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LCN12Q6JVE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms