Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CARMIL2Q6F5E8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CARMIL2Q6F5E8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CARMIL2Q6F5E8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
CARMIL2Q6F5E8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CARMIL2Q6F5E8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms