Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
WSCD1Q658N2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WSCD1Q658N2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms