Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
C9orf84Q5VXU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
C9orf84Q5VXU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
C9orf84Q5VXU9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
C9orf84Q5VXU9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms