Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF3Q5VWG9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF3Q5VWG9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms