Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACHD1Q5VU97 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACHD1Q5VU97 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms