Protein–RNA interactions for Protein: Q5MIZ7

PPP4R3B, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3BQ5MIZ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP4R3BQ5MIZ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP4R3BQ5MIZ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms