Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRDTQ58F21 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRDTQ58F21 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRDTQ58F21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms