Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF394Q53GI3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF394Q53GI3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF394Q53GI3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms