Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BBS9Q3SYG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS9Q3SYG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS9Q3SYG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms