Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C15orf59Q2T9L4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C15orf59Q2T9L4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C15orf59Q2T9L4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C15orf59Q2T9L4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms