Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PFKFB3Q16875 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PFKFB3Q16875 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PFKFB3Q16875 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKFB3Q16875 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms