Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN3Q16667 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN3Q16667 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKN3Q16667 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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